Zakaj molekularne ure niso točne pri primerjavah med sorodnimi organizmi?

Molekularne ure temeljijo na predpostavki, da je hitrost molekularne evolucije skozi čas konstantna. Vendar ta predpostavka ni vedno veljavna, zlasti pri primerjavah med organizmi, ki so v daljnem sorodstvu. To je zato, ker lahko na hitrost molekularne evolucije vplivajo številni dejavniki, vključno s spremembami v okolju, spremembami v selekcijskih pritiskih, ki delujejo na organizem, in spremembami v strukturi in funkciji proteinov, ki se preučujejo.

Zaradi teh dejavnikov se lahko hitrost molekularne evolucije močno razlikuje med različnimi linijami organizmov. To pomeni, da so lahko molekularne ure netočne pri primerjavah med oddaljeno sorodnimi organizmi, saj predpostavka o stalni stopnji evolucije ni veljavna.

Poleg tega je kalibracija molekularnih ur tudi izziv pri primerjavah med sorodnimi organizmi. To je zato, ker so fosilni zapisi pogosto nepopolni in je težko najti zanesljive datume za razhajanje različnih rodov. Posledično kalibracija molekularnih ur pogosto temelji na posrednih metodah, ki lahko vnesejo dodatno negotovost v ocene divergenčnih časov.

Zaradi teh razlogov molekularne ure niso vedno natančne pri primerjavah med sorodnimi organizmi. Vendar pa lahko še vedno zagotovijo dragocene informacije o evolucijski zgodovini različnih linij in jih je mogoče uporabiti za oceno časov razhajanja, kadar druge metode niso na voljo.